L’intérêt pour les microbiotes s’est beaucoup développé ces dernières années, alors que cette notion de flore (intestinale, buccale, pulmonaire, ...) a été longtemps reléguée au second plan. Aujourd’hui, l’impact de ces écosystèmes dans le développement de certaines pathologies commence à être mis en évidence sans pour autant connaître l’ensemble des mécanismes impliqués. Il est connu que la dysbiose du microbiote entraîne un déséquilibre entre les cytokines pro-inflammatoires et anti-inflammatoires et donc une dérégulation de la réponse immune. Ces phénomènes sont retrouvés dans la polyarthrite rhumatoïde et la parodontite, deux maladies inflammatoires chroniques bien connues et ayant des inter-relations entre elles. L’objectif de cette thèse est de comprendre le rôle de la dysbiose du microbiote dans le développement et l’entretien de la polyarthrite rhumatoïde et de la parodontite. Quel impact peut avoir le microbiote dans le développement de l’immunité et comment peut-il entraîner une perte de tolérance au soi ? Quels sont les mécanismes qui pourraient expliquer de telles interactions ?