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Master Thesis

SARS-CoV-2 et co--infections respiratoires virales

Résumé : Depuis son apparition à Wuhan en Chine en décembre 2019, le nouveau coronavirus humain nommé SARS-CoV-2 a été responsable d’une pandémie mondiale avec plus de 200 millions de cas et de 4,6 millions de décès. A l’IHU Méditerranée Infection à Marseille, nous avons commencé le dépistage de l’infection par RT-PCR à la fin du mois de janvier 2020 et nous avons inscrit ce dépistage dans une approche syndromique respiratoire plus globale avec des PCR multiplex afin de permettre à la fois le diagnostic du SARS-CoV-2 et des autres virus respiratoires. Ainsi, entre le 1er mars et le 30 avril 2020 nous avons testé par RT-PCR 4222 patients pour l’infection par le SARS-CoV-2 et les autres virus respiratoires. Un total de 643 patients a été positif uniquement pour le SARS-CoV-2 (15,2%), 1068 patients ont été positifs pour un virus autre que le SARS-CoV-2 (25,3%) et 27 patients ont été co-infectés SARS-CoV-2 / autre(s) virus respiratoire(s) (4,2%). Nous avons retrouvé parmi les co-infections surtout des rhinovirus, des coronavirus humains saisonniers et des virus grippaux. Les 27 patients comprenaient 13 hommes pour 14 femmes avec une moyenne d’âge (± écart-type) de 59,6 ± 23,8 ans. Les charges virales au diagnostic pour les patients co-infectés étaient plus élevées pour le SARS-CoV-2 et sur la durée de l’étude un patient a été admis en réanimation et un autre est décédé. Le taux de co-infection était plus élevé chez les patients SARS-CoV-2 négatifs (45%) avec une majorité de rhinovirus. Dans la littérature, de nombreuses études rapportent des séries de patients co-infectés par le SARS-CoV-2 et un ou plusieurs autres virus respiratoires mais ces taux sont considérablement variables, allant de 0,3% à plus de 30%. Le taux de ces co-infections, s’avère lié à la coïncidence de ces différents virus respiratoires. Même si les mécanismes associés à ces co-infections virales respiratoires sont assez mal connus et caractérisés il parait important de les inclure dans une démarche diagnostique syndromique afin d’adapter au mieux la prise en charge des patients.
Document type :
Master Thesis
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https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03522829
Contributor : Pharmacie Amu Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, January 12, 2022 - 12:05:14 PM
Last modification on : Friday, January 14, 2022 - 3:29:56 AM

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THESE BOSCHI 30-09-2021.pdf
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  • HAL Id : dumas-03522829, version 1

Citation

Céline Boschi. SARS-CoV-2 et co--infections respiratoires virales. Sciences pharmaceutiques. 2021. ⟨dumas-03522829⟩

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