HLA Graph : modèle d'analyse épitopique des anticorps antiHLA
Abstract
Introduction : L'identification des anticorps antiHLA est réalisée par les tests de cytométrie de flux sur billes Luminex™. Nous avons développé un modèle étudiant les corrélations des fluorescences entre les différentes paires d'allèles étudiées, que nous avons confronté aux séquences d'épitopes qu'elles partagent. Matériel et méthode : À partir des données de plus de 6000 tests Luminex™, nous avons construit des graphes de corrélations dans lesquels chaque noeud est un allèle et chaque lien correspond à une corrélation forte entre deux allèles. Résultats: Les allèles d'un même groupe sérologique étant fortement corrélés, les graphes construits s'articulent autour des groupes de réactivités croisées décrits. La distance de Spearman ρ est associée au nombre d'épitopes communs entre deux antigènes. Discussion : Les graphes de corrélations représentent un support visuel intéressant pour comprendre les réactions croisées les plus fréquemment observées. À partir de ce modèle, nous avons développé un nouvel outil de matching épitopique, accessible en ligne à l'adresse https://cusureau.pythonanywhere.com/. Conclusions : HLA Graph est un nouvel outil d'interprétation des anticorps antiHLA. Ce modèle pourrait permettre de mieux définir l'importance de chaque mismatch épitopique en transplantation.
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Usureau Cédric. Thèse d'exercice. Médecine. Biologie médicale (UPJV).pdf (13.71 Mo)
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