Apport clinique du NGS appliqué aux hémopathies myéloïdes au CHU de Clermont-Ferrand - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
Mémoires Année : 2020

Apport clinique du NGS appliqué aux hémopathies myéloïdes au CHU de Clermont-Ferrand

Résumé

Contexte : à l’ère de la médecine personnalisée, l’adaptation de la prise en charge des hémopathies myéloïdes nécessite de plus en plus d’évaluer les caractéristiques moléculaires précises des cellules malignes. Le Next Generation Sequencing (NGS) permet d’analyser, en une seule analyse, plusieurs gènes impliqués dans la physiopathologie de ces hémopathies. Même si l’utilisation de cette technique est courante dans le domaine de la recherche, son emploi dans les laboratoires de Biologie Médicale est assez récent. Ainsi, l’objectif principal de cette étude rétrospective observationnelle a été d’évaluer l’impact des mutations somatiques identifiées par NGS sur le diagnostic, le pronostic et le traitement des patients suspects ou atteints d’hémopathies myéloïdes au CHU de Clermont-Ferrand. L’objectif secondaire a consisté à évaluer la concordance entre les résultats du NGS et le diagnostic final retenu. Matériel/méthode : toutes les analyses NGS (séquenceur Miseq®, Illumina) réalisées de juillet 2017 à décembre 2019 à l’aide d’un panel myéloïde (MYS Probes®, Sophia Genetics) ont été recueillies. Chaque prescription a été classée selon son motif de demande (diagnostic, pronostic ou recherche de cible thérapeutique) et son groupe de pathologie (SMP, SMD, SF, A et LA). L’apport de l’analyse NGS (confirmation diagnostic, bon pronostic, mauvais pronostic, impact thérapeutique ou sans impact) ainsi que la concordance de conclusions entre les résultats du NGS et le diagnostic retenu final (concordance, cohérence et discordance) ont été évalués. Résultats : 328 prélèvements (288 patients) ont été analysés. Une hématopoïèse clonale a été identifiée dans 74 % des cas avec les gènes TET2, ASXL1 et DNMT3A comme les plus fréquemment mutés. Les patients atteints de LA présentent un nombre de mutations significativement plus élevé, avec des mutations des gènes FLT3, CEBPA et NPM1 exclusivement identifiées dans les LA. De même que les mutations des gènes MPL dans les SMP et ETV6 dans les SMD. La moitié des prélèvements sans mutation détecté concernait un SMP. Un tiers des résultats de l’analyse NGS a eu un impact pronostique sur la cohorte, et plus particulièrement dans les groupes SMD, SF et LA. Une confirmation diagnostique a concerné 18 % des cas, et majoritairement des prélèvements du groupe SMP. L’identification d’une cible thérapeutique a été constatée pour 12 % des prélèvements, essentiellement dans les groupes LA et Autres diagnostics. Une concordance globale de 70 % entre les résultats du NGS et le diagnostic retenu final a été retrouvée. Conclusions : l’intégration du NGS dans la pratique courante de la prise en charge des hémopathies myéloïdes est désormais admise. Une augmentation du nombre de gènes évalué dans le panel clermontois serait utile pour diminuer le nombre de cas non informatifs, en particulier pour les SMP. Une étude médico-économique sur l’utilisation de cette technique serait également intéressante.
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  • HAL Id : dumas-04089986 , version 1

Citer

William Bombardier. Apport clinique du NGS appliqué aux hémopathies myéloïdes au CHU de Clermont-Ferrand. Sciences pharmaceutiques. 2020. ⟨dumas-04089986⟩
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