Study of a carbapenemases producer enterobacteria epidemic in a French vascular surgical department
Étude d'une épidémie d'entérobactérales productrices de carbapénèmases dans un service de chirurgie vasculaire français
Résumé
Today, the struggle against antibioresistance comes to be a priority health concern. The ways of transmission of genes of antibiotic resistance must be understood. In this study we are interested in NDM-5 and OXA-48 and in their ways of horizontally transmission between bacterial strains. These two carbapenemases have been identified in four spices of enterobacteria: Citrobacter freundii, Escherichia coli, Enterobacter cloacae and Klebsiella pneumoniae in a French vascular surgery department. Since 2017, 16 clinical samples have been analyzed by the bacteriology laboratory of the Bordeaux’s University Hospital. In 2020, 7 environmental samples have been collected by the hygiene department from toilet water and swabs in the same department. BlaNDM-5 and blaOXA-48 have been identified by sequencing. Then microbiology and hygiene teams studied their genetical environment and plasmids have been recognized as the main genetical support of transmission of these two carbapenemases. Each carbapenemase studied was identified chronologically in one C. freundii clinical and environmental strain suggesting that controlling this environment could decrease the diffusion of these antibioresistance genes.
Aujourd’hui, la lutte contre l’antibiorésistance s’impose comme nouvel enjeu de santé publique. L’étude de la transmission des gènes de résistance aux antibiotiques est indispensable afin d’établir les liens épidémiologiques entre les souches bactériennes ayant acquis ces résistances aux antibiotiques et pouvant être à la source d’une dissémination de résistance aux antibiotiques. Dans un contexte d’émergence de bactéries hautement résistantes, nous nous intéressons dans cette étude aux modes d’acquisition horizontaux de deux carbapénèmases NDM-5 et OXA-48 identifiées chez quatre espèces d’entérobactérales : Citrobacter freundii, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Klebsiella pneumoniae dans un service de chirurgie vasculaire bordelais. Depuis 2017, 16 échantillons cliniques ont été analysés par le laboratoire de bactériologie du CHU de Bordeaux. En 2020, 7 échantillons environnementaux ont été collectés par l’équipe d’hygiène hospitalière depuis les locaux du même service. Les équipes de bactériologie et d’hygiène hospitalière ont voulu étudier d’abord l’environnement génétique de blaNDM-5 et blaOXA-48 préalablement identifiés par technique de séquençage. Dans un deuxième temps, les plasmides ont été reconnus comme les supports génétiques privilégiés de transmission des deux gènes de résistances aux antibiotiques. Chaque carbapénèmase étudiée a été identifiée chez des C. freundii provenant d’un échantillon clinique et d’un échantillon environnemental suggérant qu’une maitrise de l’environnement de soin puisse permettre une diminution de la propagation des gènes responsable de l’antibiorésistance.
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