Relation entre la complémentation et le taux de mutation des virus à ARN - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2024

Relationship between complementation and mutation rate in RNA viruses

Relation entre la complémentation et le taux de mutation des virus à ARN

Résumé

RNA viruses have one of the highest mutation rates of all living organisms; however, these frequent mutations can cause a loss of functionality. This bibliographic thesis focuses on a mechanism specific to viruses with segmented genomes that can compensate for deleterious mutations: complementation. This work first establishes the substitution/nucleotide/copy event unit as the one that allows a reliable comparison between the mutation rates of different viral species. Several methods for measuring the mutation rate are then detailed, the way in which they take into account the bias of natural selection and artifactual errors in particular. While they all have their respective advantages and disadvantages, the most reliable remains the Luria-Delbrück fluctuation test. Based on this observation, two comparisons, each time between two RNA viruses, one of which has a segmented genome and the other not, were carried out. The goal was to isolate the correlation between segmentation/non-segmentation and mutation rate. These comparisons highlight a mutation rate of segmented RNA viruses that is an order of magnitude higher than the one of non-segmented RNA viruses. The comparison between an experimental estimate of the mutation rate of the measles virus and the one of the influenza A virus in particular, both using a fluctuation test and presenting no bias in the analysis, encourages us to analyze this observation more thoroughly. Finally, several avenues for reflection on the mechanisms explaining this greater tolerance to mutations in segmented RNA viruses compared to non-segmented species are analyzed. After examining theoretical experimental work, complementation appears to be a completely relevant process to explain this difference in mutation rates between these two categories of RNA viruses.
Les virus à ARN présentent un des taux de mutation les plus élevés de tous les organismes vivants ; or certaines mutations peuvent engendrer une perte de fonctionnalité. Ce travail s’axe sur un mécanisme propre aux virus à génome segmenté pouvant compenser les mutations délétères : la complémentation. Cette thèse bibliographique établit l’unité substitution/nucléotide/événement de copie comme celle qui permet une comparaison fiable entre les taux de mutation des différentes espèces virales. Plusieurs méthodes de mesure du taux de mutation sont ensuite détaillées, la façon dont elles prennent en compte le biais de la sélection naturelle et les erreurs artéfactuelles notamment. Si elles ont toutes leurs avantages et leurs inconvénients respectifs, la plus fiable reste le test de fluctuation de Luria-Delbrück. Fort de ce constat, deux comparaisons, entre à chaque fois deux virus à ARN dont l’un présente un génome segmenté et l’autre non, ont été réalisés. Le but était d’isoler la corrélation entre segmentation/non-segmentation et taux de mutation. Ces comparaisons permettent de mettre en évidence un taux de mutation des virus à ARN segmenté plus élevé d’un ordre de grandeur que celui des virus à ARN non-segmentés. La comparaison entre une estimation expérimentale du taux de mutation du virus de la rougeole et une de celle du virus influenza A en particulier, utilisant toutes deux un test de fluctuation et ne présentant aucun biais à l’analyse, incite à analyser cette constatation plus en profondeur. Enfin, plusieurs pistes de réflexion sur les mécanismes permettant d’expliquer cette plus grande tolérance aux mutations des virus à ARN segmentés par rapport aux espèces non segmentés sont analysés. A l’issue de l’examen de travaux expérimentaux théoriques, la complémentation apparait comme un processus tout à fait pertinent pour expliquer cet écart de taux de mutation entre ces deux catégories de virus à ARN.
Fichier principal
Vignette du fichier
T-2024-011.pdf (1.7 Mo) Télécharger le fichier
Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

dumas-04625293 , version 1 (26-06-2024)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-04625293 , version 1

Citer

Raphaël Villeneuve. Relation entre la complémentation et le taux de mutation des virus à ARN. Médecine vétérinaire et santé animale. 2024. ⟨dumas-04625293⟩
0 Consultations
0 Téléchargements

Partager

Gmail Mastodon Facebook X LinkedIn More