CD8 T cells during lupus nephritis: single-cell-RNA-sequencing analysis or renal, urinary and blood cells
Rôle des lymphocytes T CD8 au cours de la néphrite lupique : analyse par single-cell-RNA-sequencing de CD8 rénaux, urinaires et sanguins
Résumé
Introduction: lupus nephritis (LN) is a frequent and severe manifestation of systemic erythematosus lupus. Risk of end stage renal disease remains high. Tissue lesions are a consequence of immune activation directed against nuclear antigens. CD8 T cells are one of the predominant cell types infiltrating the kidney during LN, and their presence is correlated with the severity of the disease. However, their role in the pathogenesis of the disease is not clear. Methods: sorted CD8 T cells of renal, urinary and blood samples of two patients with active LN were analyzed by single-cell-RNA-sequencing. After dimensionality reduction, markers characterizing subpopulations, cytotoxicity, exhaustion and interferon-stimulated-genes were studied, and trajectory analysis was performed. Results: renal and urinary CD8 T cells expressed more markers of effector populations and cytotoxicity, compared to blood cells. Exhaustion markers were poorly expressed. Various pathways could be implicated in T cell activation in the kidney: central memory cells could diffenciate into effector memory cells under the influence of interferon. Precursor exhausted cells could diffenciate into terminally exhausted cells, with the help of CD4 T cells and dendritic cells. Blood effector memory cells could infiltrate the kidney. Conclusion: renal and urinary CD8 T cells express markers of effector cells and cytotoxicity during LN. They could participate in LN pathogenesis.
Introduction : la néphrite lupique (NL) touche environ 50 % des patients atteints de lupus érythémateux systémique et le risque d’insuffisance rénale terminale demeure élevé. La réaction auto-immune, dirigée contre les antigènes nucléaires, fait intervenir plusieurs acteurs responsables des lésions tissulaires. Le lymphocyte T CD8 est un des types cellulaires majoritaires infiltrant le rein durant la NL. Sa présence est corrélée à la gravité de cette pathologie. Son rôle dans la pathogénie de la maladie n’est pas clairement élucidé, et la littérature est discordante. Méthodes : des CD8 rénaux, urinaires et sanguins triés de deux patientes présentant une poussée de NL étaient analysés par single-cell-RNA-sequencing. Les clusters obtenus par réduction de dimensionnalité étaient caractérisés avec les marqueurs de sous- populations de CD8, de cytotoxicité, d’épuisement, et de signature interféron, puis une analyse de trajectoire était réalisée. Résultats : les CD8 rénaux et urinaires exprimaient plus de marqueurs d’effecteurs et de cytotoxicité au cours de la NL, par rapport au CD8 sanguins. Les marqueurs d’épuisement étaient peu exprimés. Plusieurs voies pourraient participer à l’activation des CD8 effecteurs au cours de la NL : des CD8 centraux mémoires rénaux pourraient se différencier en effecteur mémoire avec une participation de l’interféron, des CD8 « precursor exhausted » pourraient se différencier en « terminally exhausted » avec l’aide des CD4 et des cellules dendritiques, des CD8 effecteurs mémoires sanguins pourraient infiltrer secondairement le rein. Conclusion : les CD8 rénaux et urinaires sont effecteurs cytotoxiques au cours de la NL et pourraient ainsi jouer un rôle au cours du développement de cette pathologie.