De nos jours, le cobaye Cavia porcellus est, en France, le deuxième nouvel animal de compagnie le plus médicalisé après le lapin de compagnie. Ses besoins spécifiques nécessitent de respecter un certain nombre de règles relatives à son entretien, son environnement et son alimentation dans les foyers afin de prévenir une grande partie des maladies qui peuvent le toucher. Les affections digestives sont une dominante pathologique du cobaye mais l’importance du parasitisme digestif demande à être mieux appréciée. Le cochon d’Inde semblerait être plus infesté par des protozoaires que des helminthes. Toutefois, il n’existe à l’heure actuelle qu’une seule étude sur la prévalence du parasitisme digestif chez cette espèce en France avec 4,2 % d’animaux parasités exclusivement par Eimeria caviae parmi 24 individus. La première partie de ce travail présente une description de la zootechnie du cobaye et une revue des maladies digestives en insistant sur l’étiologie parasitaire. Les principales méthodes de détections de ces parasites sont ensuite détaillées ainsi que les moyens à mettre en oeuvre pour prévenir et traiter ces affections. La seconde partie est une étude prospective ayant pour objectif de déterminer la prévalence du parasitisme digestif et d’évaluer le potentiel impact de différents facteurs de risques sur cette prévalence : la saisonnalité, l’administration préventive de traitement antiparasitaire, la présence d’un contact inter-spécifique plus ou moins étroit, le contact avec le milieu extérieur, l’hygiène des fruits et légumes consommés ainsi que leurs origines. Dans un premier temps, l’étude a pris connaissance des caractéristiques des 158 cobayes sains recrutés, de leurs conditions de vie, de leurs rations alimentaires ainsi que leurs antécédents médicaux. Puis 114 coproscopies par la méthode quantitative et semi-quantitative de flottation ont été réalisées permettant d’identifier des oeufs de Paraspidodera uncinata et des oeufs non identifiés d’Ascarides avec une prévalence totale de 17,5 %. Cinquante-quatre cochons d’Inde ont eu un suivi coproscopique s’étalant sur une année entière (de décembre 2017 à février 2019) à raison d’une coproscopie par saison. Cette étude n’a pas permis de mettre en évidence une association entre la présence de parasitisme digestif et une saison de l’année en particulier. En croisant les caractéristiques des cochons d’Inde avec leurs résultats coproscopiques, la présence de contacts avec des animaux d’espèces différentes, la vermifugation, l’accès à l’extérieur, l’hygiène et l’origine des végétaux consommés ne semblent n’être ni des facteurs de risque, ni des facteurs protecteurs d’une infestation par des parasites digestifs. Cette étude préliminaire suggère qu’il est inutile d’administrer à titre préventif des traitements contre les parasites digestifs chez le cobaye.