Mémoires Année : 2023

Dientamoeba fragilis: literature review and implementation of a molecular detection technique in stool samples at Bordeaux University Hospital

Dientamoeba fragilis : revue bibliographique et mise en place d'une de détection par biologie moléculaire dans les selles au CHU de Bordeaux

Résumé

The presented work focuses on improving the diagnosis of intestinal parasitic infections, with a specific emphasis on Dientamoeba fragilis, a parasite with controversial pathogenic aspects. A review of the literature reveals that the prevalence of D. fragilis is high, but its detection using traditional methods such as optical microscopy is limited due to its biological and morphological characteristics. Molecular diagnostic methods, including real-time PCR, offer new solutions for detecting this parasite. Bordeaux University Hospital has decided to implement a real-time multiplex PCR technique, and our work falls within the scope of method verification. The method verification trials presented are divided into three phases aimed at evaluating the analytical performance of the chosen kit. A comparison between the selected kit and other diagnostic methods demonstrates satisfactory results compared to other PCR kits and a significant improvement in sensitivity compared to optical microscopy. The study of the technique's repeatability is then presented. This work has contributed to the routine implementation of this molecular biology technique at Bordeaux University Hospital and shed light on D. fragilis, a relatively unknown protozoan.

Le travail présenté se penche sur l'amélioration du diagnostic des infections parasitaires intestinales, en se concentrant notamment sur Dientamoeba fragilis, un parasite aux aspects pathogènes controversés. L'étude de la bibliographie révèle que la prévalence de D. fragilis est élevée, mais que sa détection par les méthodes traditionnelles, comme la microscopie optique, est limitée en raison de ses caractéristiques biologiques et morphologiques. Les méthodes de diagnostic moléculaire avec notamment la PCR en temps réel offrent de nouvelles solutions pour la mise en évidence de ce parasite. Le CHU de Bordeaux a décidé de mettre en place une technique de PCR multiplex en temps réel et notre travail entre dans le cadre de la vérification de méthode. Les essais de vérification de méthode présentés sont séparés en trois phases visant à évaluer les performances analytiques du kit choisi. Une comparaison entre le kit choisi et d’autres méthodes diagnostiques montre des résultats satisfaisants par rapport aux autres kits de PCR et une amélioration nette de la sensibilité par rapport à la microscopie optique. L’étude de la répétabilité de la technique est ensuite présentée. Ce travail a contribué à la mise en place en routine de cette technique de biologie moléculaire au CHU de Bordeaux et à mettre en lumière D. fragilis, un protozoaire méconnu.

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  • HAL Id : dumas-04789077 , version 1

Citer

Quentin Avargues. Dientamoeba fragilis : revue bibliographique et mise en place d'une de détection par biologie moléculaire dans les selles au CHU de Bordeaux. Sciences du Vivant [q-bio]. 2023. ⟨dumas-04789077⟩
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