Étude PYG : étiologie microbienne et statut épidémiologique des abcès hépatiques à pyogène en Guadeloupe - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
Master Thesis Year : 2023

PYG study: microbial etiology and epidemiological status of pyogenic liver abscesses in Guadeloupe

Étude PYG : étiologie microbienne et statut épidémiologique des abcès hépatiques à pyogène en Guadeloupe

Abstract

Introduction: Pyogenic liver abscess is a rare condition, difficult to diagnose due to its aspecific clinical presentation. Diagnosis is made radiologically. Diabetes has been identified as a risk factor. Bacteriological documentation is dominated by enterobacteria. For several years now, we have been witnessing the emergence of hypervirulent K.pneumoniae, responsible for a growing number of cases of clinically aggressive liver abscesses. Identification of these new strains is based on genomic studies. Hypermucoviscosity and siderophore production are important markers of virulence. Epidemiologic data in the Caribbean are poor. The main aim of this study is to determine the microbial etiology of pyogenic liver abscesses in Guadeloupe, using a conventional bacteriological approach and genomic analysis. Method: This is a prospective, single-centre, descriptive study of all patients over 18 years of age admitted to hospital with radiologically confirmed pyogenic liver abscess between March 2021 and June 2023. Patients who were minors or who refused to participate in the study were excluded. Data collection, management and follow-up were carried out over 3 visits. Results: 22 patients with an established diagnosis of liver abscess were included in this trial. Of these, 6 cases had to be stopped prematurely: 3 died and 3 were lost to follow-up. The most common bacterial identifications were K.pneumoniae, E.coli and S.constellatus. 2 isolates of K.pneumoniae had a genetic background of hypervirulence. The population was 77.3% represented by men. The median age was 69. The majority were of Afro-Caribbean origin. 52% of patients were diabetic and 61% had high blood pressure. The clinical presentation included fever in 50% of cases and abdominal pain in 57.1%. The biological inflammatory syndrome was significant, with a median CRP of 250 mg/L. The diagnosis was made by CT scan in 86% of cases and by ultrasound in 14%, with the majority of cases being single abcesses. Conclusion: This study has shown that the microbial etiologies of pyogenic liver abscesses in Guadeloupe are multiple and correspond mainly to enterobacteria (E.coli, K.pneumoniae) with invasive potential. The main gateway is the digestive tract. Diabetes seems to be associated with this pathology. However, the small number of patients made it impossible to calculate Odds Ratios for the risk factors. Consequently, this work will be completed by a multicenter retrospective study carried out in other hospitals of Guadeloupe in order to obtain a more exhaustive report.
Introduction : L’abcès hépatique à pyogène est une pathologie rare et de diagnostic difficile en raison d’une présentation clinique aspécifique. Le diagnostic est radiologique. Le diabète est un facteur de risque identifié. La documentation bactériologique correspond majoritairement à des entérobactéries. Depuis plusieurs années, nous assistons à l’émergence de K.pneumoniae hypervirulentes responsables d’un nombre croissant de cas d’abcès hépatiques aux formes cliniques agressives. L’identification de ces souches repose sur leur étude génomique. L’hypermucoviscosité et la production de sidérophores sont des marqueurs de virulence importants. Il existe peu de données épidémiologiques sur cette maladie au sein du territoire caribéen. L’objectif principal de cette étude est de déterminer l’étiologie microbienne des abcès hépatiques à pyogène par une approche bactériologique classique et par analyse génomique en Guadeloupe. Méthode : Il s’agit d’une étude descriptive prospective et monocentrique portant sur tous les patients de plus de 18 ans hospitalisés pour abcès hépatique à pyogène confirmé radiologiquement entre mars 2021 et juin 2023. Les patients mineurs ou refusant de participer à l’étude étaient exclus. Le recueil des données, la prise en charge et le suivi étaient réalisés en 3 visites. Résultats : 22 patients avec un diagnostic établi d’abcès hépatique ont été inclus dans cette étude. Parmi eux 6 cas ont justifié d’un arrêt prématuré de l’étude : 3 décès et 3 perdus de vue. Les identifications bactériennes les plus retrouvées étaient K.pneumoniae, E.coli et S.constellatus. 2 isolats de K.pneumoniae portaient un fond génétique d’hypervirulence. La population était représentée par 77,3% d’hommes. L’âge médian était de 69 ans. La majorité était d’origine afro-caribéenne. 52% des patients étaient porteurs d’un diabète et 61% étaient atteints d’hypertension artérielle. La présentation clinique retrouvait une hyperthermie dans 50% des cas et des douleurs abdominales dans 57,1% des cas. Le syndrome inflammatoire biologique était important avec une CRP médiane à 250 mg/L. Le diagnostic était scannographique dans 86% des cas et échographique dans 14% des cas avec une majorité d’abcès uniques. Conclusion : Cette étude a permis de montrer que les étiologies microbiennes des abcès hépatiques à pyogène en Guadeloupe correspondent majoritairement à des entérobactéries (E.coli, K.pneumoniae) ayant un potentiel invasif. La porte d’entrée principale est digestive. Le diabète semble être associé à cette pathologie. Cependant, l’effectif faible n’a pas permis de calculer des Odds Ratio concernant les facteurs de risques. Par conséquent, ce travail sera complété par une étude rétrospective multicentrique menée au sein des autres centres hospitaliers Guadeloupéens afin d’obtenir une plus grande exhaustivité. Introduction.
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dumas-04803262 , version 1 (25-11-2024)

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Cite

Zoé Labat. Étude PYG : étiologie microbienne et statut épidémiologique des abcès hépatiques à pyogène en Guadeloupe. Hépatologie et Gastroentérologie. 2023. ⟨dumas-04803262⟩
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