Descriptive study of bovine tuberculosis in Haute-Corse between 2014 and 2022
Étude descriptive de la tuberculose bovine en Haute-Corse entre 2014 et 2022
Résumé
Bovine tuberculosis is a chronic zoonosis caused by bacteria of the Mycobacterium tuberculosis complex, mainly Mycobacterium bovis. The disease mainly affects cattle, but many other species are also receptive. Haute-Corse is one of seven French administrative area still infected. The control of this infection is a major challenge, as it is the only French department in which outbreaks have been observed on pig and goat farms. Objective: The aim of this work was to carry out a descriptive study of the epidemiological situation of cattle and pig farms in Haute-Corse regarding bovine tuberculosis between 2014 and 2022, to provide indicators of the extent of the infection in the area. Material and method: Databases were provided by the local state animal health services. They contained all suspected and confirmed outbreaks between 2014 and 2022, as well as animals slaughtered over the period and their diagnostic tests’ results. The number of animals identified by electronic boluses between 2019 and 2022 was also provided. Results: The study showed a median intra-herd prevalence of around 5 % between 2019 and 2022, with 92 % of the 37 outbreaks studied having an intra-herd prevalence greater than 1 %. In addition, the rate of cattle, pig and mixed farms with at least one recontamination over the period was high (18 %). Spoligotypes detected were specific to Corsica, and have been identified in cattle, pigs and wildlife. Discussion: This work has shown that bovine tuberculosis is still very prevalent in Haute-Corse. The outbreaks recently detected have probably been infected for a long time, which explains why the intra-herd prevalence is higher than in mainland French herds. However, with the introduction of the IFN-γ test for programmed screening of cattle herds, it seems that the number of outbreaks discovered each year is increasing. Although this trend is still difficult to assess due to the lack of hindsight. It would suggest a long-term improvement in the situation in Haute-Corse, with earlier detection of outbreaks.
La tuberculose bovine est une zoonose, d'évolution chronique, causée par les bactéries du complexe Mycobacterium tuberculosis et principalement par Mycobacterium bovis. Cette affection touche majoritairement les bovins mais de nombreuses autres espèces sont aussi réceptives. La Haute-Corse fait partie des sept départements français encore atteints par la tuberculose bovine et pour lesquels la gestion de cette affection est un enjeu majeur. De plus, il s'agit du seul département français dans lequel a été observé des foyers en élevages porcins et caprins. Objectif : Cette thèse consistait à réaliser une étude descriptive de la situation épidémiologique des élevages de Haute-Corse vis-à-vis de la tuberculose bovine entre 2014 et 2022 afin de fournir des indicateurs témoignant de l'importance de l'affection dans le département. Matériel et méthode : L'étude s'est appuyée sur l'analyse des bases de données fournies par la DDETSPP de Haute-Corse. Celles-ci recensaient l'ensemble des foyers suspects et confirmés entre 2014 et 2022 ainsi que l'ensemble des animaux abattus sur la période et les résultats des tests et observations effectués. Le nombre d'animaux identifiés par bolus électroniques entre 2019 et 2022 était également fourni. Résultats : L'étude a montré une prévalence intra-cheptel médiane oscillant autour de 5 % entre 2019 et 2022, avec 92 % des 37 élevages étudiés montrant une prévalence intra-cheptel supérieure à 1 %. De plus, le taux d'élevages bovins, porcins et mixtes se recontaminant au moins une fois sur la période était élevé (18 %). Par ailleurs, les spoligotypes détectés sont propres à la Corse, et sont identifiés chez les bovins, les porcins et la faune sauvage. Discussion : Cette thèse a montré la présence encore importante de la tuberculose bovine en Haute-Corse. Il est possible que les foyers détectés récemment (ou que des foyers non-encore identifiés) soient infectés depuis longtemps expliquant la prévalence intra-cheptel supérieure à celle attendue dans les élevages français. Cependant, avec la mise en place d'une prophylaxie s'appuyant sur le test de dosage de l'IFN-γ, le nombre de foyers découverts par an augmente. Cette évolution bien qu'encore difficile à évaluer à cause du manque de recul, serait en faveur d'une amélioration à long terme de la situation en Haute-Corse avec un dépistage plus précoce des foyers.
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