Gestion de données et de connaissances appliquée aux bioprocédés - DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance Accéder directement au contenu
Mémoires Année : 2010

Gestion de données et de connaissances appliquée aux bioprocédés

Résumé

This work deals with the problem of computing biological process with the aim of make durable scientic data, raw data and context data. Aware that experiments, the former act before producing data, are not enough documented and are rarely reused, it tries to improve future use of data. This approach use business modelization of biological process, pointing out the concept of raw material, adding product and dierent kind of measurement. A hierarchy of comments, research thema is provided (event, operation, analysis...) and the instrumentation context concept is introduce. This analysis lead us to divide the information system in two part, a model for raw data which be implemented in a classical relational DB way and a semantic model build as an ontology which will use the semantic web technology. This system allow to annotate the experiments. At last, the study provide a way of implementing the system and provide sone possible technical choices. The client / server architecture is choosen with a rich Internet interface associated with a server side PHP application and a web service for querying ontologies.
Ce travail aborde le thème de l'informatisation des procédés sous l'angle de la pérennisation des données scientifiques, données brutes et contexte scientifique qui est à leur origine. Il s'intéresse à améliorer leur utilisabilité dans le temps en partant du constat que les expérimentations, acte fondamental de la production de données, sont souvent mal documentées et ne permettent que très rarement d'être réutilisées. L'approche présentée met en avant l'analyse métier du domaine des bioprocédés en détaillant les concepts de matières premières, produits ajoutés et des différents type de mesures. Elle propose une hiérarchie de commentaires (événements, opérations, analyses...) ainsi que des thèmes de recherche et associe un contexte d'instrumentation, mémoire de l'installation technique du procédé. Cette analyse débouche sur la division du système d'information en deux parties, un modèle pour les données brutes qui prendra la forme classique d'une base de données relationnelle, un modèle sémantique sous forme d'une ontologie qui utilisera les technologies du Web sémantique. Ce système permettra d'annoter les expérimentations. Pour terminer, le mémoire propose une approche pour l'implémentation en machine en justifiant les différents choix technologiques. L'architecture client / serveur est retenue, avec une interface Internet riche associée à une application Web écrite en PHP et un mécanisme de service Web pour l'interrogation des ontologies.
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Dates et versions

dumas-00524561 , version 1 (08-10-2010)

Identifiants

  • HAL Id : dumas-00524561 , version 1

Citer

Alexandre Granier. Gestion de données et de connaissances appliquée aux bioprocédés. Base de données [cs.DB]. 2010. ⟨dumas-00524561⟩
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