Le Jardin royal des plantes médicinales détient depuis sa fondation des collections minéralogiques. Alors qu’elles sont présentées dans le Droguier du Roi au cours du XVIIe siècle et pendant le premier quart du XVIIIe siècle, elles font ensuite partie intégrante du Cabinet d’Histoire naturelle remodelé par Buffon. Ce dernier est la figure marquante de l’évolution du Jardin car il pose, par ses travaux et agrandissements, les bases de ce qui allait devenir le Muséum national d’Histoire naturelle institué en 1793. Les collections minéralogiques appartenant au troisième règne de la nature selon l’expression consacrée, bénéficient petit à petit d’une présentation à part dans le Cabinet d’Histoire naturelle au XVIIIe siècle, où une salle finit par leur être exclusivement dédiée. Avec le XIXe siècle, ce concept des trois règnes de la nature est pleinement exprimé avec la création de la Galerie de Minéralogie ainsi que des Serres chaudes, conçues par l’architecte du Muséum de l’époque Charles Rohault de Fleury. L’aménagement des collections dans cette Galerie adopte alors les principes nouveaux de classification minéralogique, développés pour partie par les Professeurs successifs de minéralogie de l’établissement. Le cadre enfin des collections est organisé de telle façon qu’une muséographie d’ensemble est aménagée entre les collections et l’espace d’exposition.