Application des techniques de séquençage à haut-débit dans le diagnostic d'urgence des méningites infectieuses
Résumé
La méningite infectieuse est une affection grave et potentiellement mortelle causée par plusieurs microorganismes. Le diagnostic repose sur des signes cliniques évocateurs et la réalisation d’une ponction lombaire à la recherche de signes biologiques de méningites et de l’agent infectieux responsable.
Le diagnostic étiologique est actuellement réalisé en urgence par Polymérase Chain Reaction (PCR). Cette technique, bien que rapide et très sensible, ne permet de rechercher qu’un nombre limité de germes et ne permet pas la caractérisation complète du germe.
Dans ce travail collaboratif, nous avons étudié l’intérêt des technologies de séquençage à haut débit qui ont récemment fait leur apparition en diagnostic de routine et permettent aujourd’hui de séquencer et analyser les prélèvements dans des temps très réduit. Ces nouvelles méthodes moléculaires ont de plus l’avantage d’être des systèmes ouverts, permettant d’identifier toute séquence d’acide nucléique, sans à priori concernant le germe. Nous proposons donc cette technologie comme alternative à la PCR dans le diagnostic étiologique d’urgence des méningites infectieuses.
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)